Cambiar dato de relacion N-N segun condicion.

Buenas tardes, tengo un form con una relacion N-N tipo checkbox, y necesito manupular esos checkbox con respecto a una condicion, es decir poder hacerle un checed=true; es decir, manipular un dato de ese N:N como si el usuario le diera click sobre la opcion para marcarlo, pero no se como hacerlo, tal vez alguno de ustedes sabe como.

Saludos cordiales, y desde ya gracias.

if you do a check in the case N: N you make an insert in a table, if you make a uncheck you do a delete, so to have your condition you make a request on this table: ex:
select * from your table where column name in (the name of the table)
or
select * from your table where column name not int (the name of the table)
you can create your condition on exist or not in the table